대학기관 평가인증은 교육부에서 지정한 한국대학교육협의회 부설 한국대학평가원에서 시행하고 있다. 대학사명 및 발전계획, 교육, 대학구성원, 교육시설, 대학재정 및 경영, 사회봉사 등 6개 영역을 평가, 인증해 사회적 공신력을 부여하고 있다.
아세아연합신학대학교 관계자는 "대학기관 평가인증을 획득함에 따라 대학교육의 질 보증과 국제적 통용성을 다시 한번 확인하게 됐다"며 "이를 토대로 아세아복음화와 선교지향적 글로벌 리더 양성에 더욱 힘 써 나갈 예정"이라고 말했다.