류임철 행정부시장을 단장으로 시행지원팀과 접종관리팀, 접종시행팀, 언론대응팀 등 4팀 26명을 중심으로, 자치분권국 등의 지원을 받아 시 전체가 함께 유기적으로 협조할 수 있도록 구성됐다.
추진단 주요 업무로는 △시행지원팀은 관계 부처 협력, 보고 및 통계관리, 접종센터 운영 지원 △접종관리팀은 접종관리 계획수립, 접종센터 선정관리, 이상반응 모니터링 역할 △접종시행팀은 백신수급 관리, 위탁의료기관 지정, 접종대상자 파악, 예약 관리, 접종이상반응 신고접수 업무 △언론대응팀은 접종 홍보 및 언론 대응 등을 수행한다.
신속하고 안전한 예방접종을 위해 의사회, 소방본부, 경찰청이 참여하는 지역협의체를 구성해 접종에 대한 전문가 조언, 접종센터 치안, 접종 후 응급환자 이송 담당을 맡길 예정이다. 시는 인플루엔자가 유행하기 전에 백신접종을 모두 완료할 계획으로, 만 18세 이상 백신 접종대상자(27만 2,600여 명) 중 질병관리청 지침에 따라 우선접종순서를 선정하고, 백신접종을 위한 접종센터와 위탁의료기관을 준비 중이다.