이에 방역대책본부는 분뇨 처리장비를 긴급 투입하여 AI발생 농가와 예방적 살처분 농가의 분뇨처리와 농장 내․외부 생석회 도포, 액체 소독작업을 진행하는 한편 방역소독 매뉴얼을 만들어 거류면 AI발생지 이동통제초소(3개소)에는 일반인의 진출입 시에도 축산 차량 및 축산 관계자에 준하는 방역을 하고 AI발생지 반경 3km(보호지역)에 대한 방역활동 강화, 매몰지 주변 휀스설치 작업을 준비하는 등 AI 확산 방지를 위해 온 힘을 쏟고 있다.
아울러 한시도 소홀할 수 없는 구제역 방역관리를 위해 농가별 담당공무원 234명을 실명으로 지정해 예방접종을 독려하고 축사내외 소독을 지도하는 등 방역에 만전을 기하고 공동방제단(7개반)을 투입해 고성 가축전자경매시장과 마동호, 대가저수지 등 주요 철새도래지 방역, 거류면 2570 전 가구와 13개 읍․면 1500여 축산농가에 대해서도 방역활동을 계속해 나간다는 계획이다.
한편, 중장기적으로 가축 전염병의 근본적인 문제 해결과 효율적인 관리를 위해 입식․출하가 공동으로 이루어져 가축전염병에 취약한 기업위탁 가금류 사육농가에 대한 향후 특별 관리방안을 모색하고 있다. 또한 소규모 가금류 사육 농가에 대해서는 수매방안 모색 등 전방위적인 대책을 검토 중에 있다.