2012년 4월 안철수 의원이 정치참여를 고민하다 창립한 이 재단은 2013년 8월 성남시 분당구에서 서울시 강남구로 주사무소를 옮겼다.
강남구는 '대도시 밖에 있는 주사무소를 대도시로 이전했다'며 관련법에 따라 중과세율을 적용해 등록면허세 6억2000여만원과 지방교육세 1억2400여만원을 부과했다.
그러나 재단은 성남도 대도시인 만큼 대도시 '밖'에서 강남으로 주소지를 옮긴 게 아니라며 강남구의 무거운 과세에 불복해 소송을 냈다.
법원이 재단의 손을 들어주면서 전체 세액은 7억4400여만원에서 등록면허세 7만5000원와 지방교육세 1만5000원 등 9만원으로 줄었다.
원래 법인명은 '안철수재단'이었으나 안 의원이 2012년 대선후보를 사퇴하고 본격적으로 정치에 나서자 이듬해 동그라미재단으로 개명했다. 일자리 창출 기여·교육 지원 등이 주 사업이다.