자본금은 55억2522만원으로 1주당 액면가액은 1만원, 발행주식수는 55만2522주다. 주요주주로는 (주)천해지(지분율 39.4%)와 김한식 청해진해운 대표(11.6%) 그리고 (주)아이원아이홀딩스(7.1%)가 있다. 이밖에 이효자씨(2.7%)와 기타주주(39.2%)로 구성됐다.
한편 청해진해운의 최대주주인 (주)천해지는 경상남도 고성에 본사를 두고 있는 강선 건조업체로 대기업으로 분류돼 있다. 지난 2005년에 설립됐으며 임직원과 주주수는 각각 152명과 22명이다. (주)천해지의 주주현황을 살펴보면 지난해말 기준 (주)아이원아이홀딩스가 최대주주로 42.81%의 지분을 보유하고 있다.
(주)천해지의 최대주주인 (주)아이원아이홀딩스는 지난 2007년에 설립된 회사로 경영자문 및 경영컨설팅업을 영위하고 있다. (주)아이원아이홀딩스의 주요 주주는 유혁기씨(19.44%), 유대균씨(19.44%), 김혜경씨(6.29%) 등이다. 기타 소액주주가 54.83%의 지분을 보유하고 있다.