국립의과학지식센터는 보건의과학 분야 논문과 보고서 등 전문학술정보를 수집·보존하며, 연구자를 위한 최신 연구정보를 제공하게 된다.
복지부에서 지원한 연구과제에서 생산한 학술논문과 기초 연구데이터 등 지식정보 자원을 관리하는 데이터센터 역할을 수행한다.
이 센터는 2010년 건립계획을 확정한 후 총사업비 159억원이 투입해 지하1층과 지상 4층 총 6669m2(2017평) 규모로 건립됐다.
장서 약 45만권을 보존할 수 있는 수장고를 비롯해 관련 정보를 검색하고 이용하는 종합자료실, 멀티미디어자료실, 전산교육실 등을 구축했다.