그러나 한나라당은 당·청 갈등을 넘어 여권 ‘권력투쟁’ 논란으로까지 번진 정 후보자의 사퇴가 자칫 야권에 정국 주도권을 내주는 계기가 되지 않을까 그 파장을 최소화하려고 한 반면, 민주당 등 야당은 청와대 인사라인의 문책을 촉구하며 대대적인 공세에 나섰다.
배은희 한나라당 대변인은 이날 논평에서 정 후보자의 사퇴를 “집권 4년차 이명박 정부의 국정운영에 부담을 주지 않고, 국민감정을 고려해 내린 용단”이라고 평가했다.
이어 그는 “한나라당은 앞으로도 더 낮은 자세로 국민의 소리에 귀 기울여, ‘친서민 중도실용’ 기조를 강화해나가겠다”고 강조했다.
반면 전현희 민주당 원내대변인은 “정 후보자의 사퇴는 이명박 대통령의 불공정한 측근 챙기기 보은인사에 대한 국민의 심판이자 당연한 사필귀정의 결과”라고 지적하며 “문제는 이 대통령의 잘못된 인사 철학에 있다. 정치적 중립이 생명인 감사원장 인사에 ‘측근 챙기기’란 무리수를 둔 대통령의 대국민 사과와 청와대 인사라인에 대한 엄중한 문책이 뒤따라야 한다”고 요구했다.
박선영 자유선진당 대변인도 “(정 후보자의 사퇴는) 때가 매우 늦었다. 이렇게 늦을 것이었다면 자진사퇴보다는 청와대의 지명철회가 나았을 것”이라며 “이번 사태로 청와대는 레임덕(임기말 권력누수 현상)을 자초하고 한나라당은 스스로 발등을 찍는 등 동반추락한 셈”이라고 비판했다.
우위영 민주노동당 대변인 또한 “정 후보자 한 사람의 자진사퇴로 청와대의 잘못을 가리려 해서는 절대 안 된다”고 주장했다.